塔最早起源於古代印度，其目的是為了存放圓寂高僧的靈骨，大唐時期的玄奘法師遠赴印度取經，帶回來的不止是佛學，還有佛塔，玄奘法師圓寂之後，他的頂骨舍利被安放在了陜西的紫閣寺塔，不過，隨著朝代的更替，紫閣寺塔也被破壞，唐朝末年，朱溫遷都洛陽時，臨走前在長安大肆破壞，曾經繁華的天下第一城變成廢墟，紫閣寺塔也破敗不堪；在宋朝時期，一個叫做可政的和尚見紫閣寺塔輝煌不在，將玄奘頂骨迎回了南京，並在天禧寺旁另建一石塔供奉頂骨；後來在明朝時期，天禧寺毀於大火，在原址上修建了一座大報恩寺，玄奘頂骨被遷入其中，深受百姓的朝拜。
不過到了清朝時期，中國內憂外患，更是爆發了太平天國這樣的大型起義行動，大報恩寺被燒毀，玄奘頂骨消失在人們的視野中，百姓已經處在水深火熱之中，沒有心思顧及其他，於是玄奘頂骨也就此長埋地下，1937年，日本全面侵華，貪婪和野心讓他們在南京犯下了滔天罪行，同時，他們也想占有中國的一切，對於一些文物的覬覦之心也從未少過，將各地搜刮來的珍寶運回本國，並且還四處偷盜古墓，有一點讓他們沒想到的是，中國真是個寶地，隨便在廢墟上面一挖，就挖到了絕世靈物！
1942年11月，駐守在南京的日軍決定在大報恩寺原址上修建一座“稻荷神社”，當時擔任施工任務的是高森隆介的部隊，他們在挖地基的時候，挖出了一個石函，石函上面記錄著玄奘頂骨遷移的全過程，並且石函裏還有一個精美錦盒，他們打開一看竟然是一塊頂骨，日本對於佛文化也是頗為崇拜，他們查閱了大量的資料後，發現挖掘的這處地方正是封存玄奘頂骨的大報恩寺遺址，那麽這塊頂骨是否就是玄奘的呢？經過日本專家的檢驗，是玄奘頂骨無疑，玄奘不管是在中國還是日本，都備受尊敬，更何況是玄奘唯一留下來的頂骨呢？所以日本很想將這塊頂骨占為己有。
日軍雖然秘密封鎖了這個消息，但是世上沒有不透風的墻，很快的日軍發現玄奘頂骨的消息出現在中國各大報紙上，他們想偷運回國的舉動更是激起了民憤，民眾高呼日軍不得帶走中華民族的“佛魂”，此時日軍在太平洋戰場上受挫，銳氣大減，迫於輿論壓力，日軍決定與汪偽政府平分這塊頂骨，一半還給了中國，另一半則秘密運到了日本。非常遺憾的是，這半塊頂骨至今未回到祖國，並且還分散於日本的各大寺院，不過日本人倒也非常虔誠，每日朝拜玄奘頂骨的人絡繹不絕。
